消化内镜室是我院重点发展的特色专科。现拥有先进的奥林巴斯消化内镜和富士能主机各一套，以及高清电子胃镜、电子结肠镜、电子支气管镜、膀胱镜、C14、13呼气试验检测仪和氩等离子凝固电切设备（氩气刀）等，并配备了国内先进的肯格王清洗消毒系统，全自动清洗机，严格执洗消操作流程和消毒质量监控，切实保证受检病人的卫生安全。除开展无痛胃肠镜检查外，内镜室还开展内镜下的治疗：消化息肉的内镜下摘除术、内镜下异物取出术、内镜下止血术及胃镜下置管术等。年胃肠镜检查人数约8000余人次，年呼气试验检查3000余人次，年无痛胃肠镜检查1000余人次，年内镜下治疗超过500人次。